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서비스연구용서비스Transcriptome Sequencing
Transcriptome Sequencing
Transcriptome Sequencing
차세대 염기서열 분석법이라 불리는 NGS(Next Generation Sequencing) 기술을 통해 생산한 RNA의 정보를 분석하는 방법입니다. RNA read 정보를 분석하여 RNA의 정보를 확인하기 때문에 발현 중인 유전자를 광범위하게 파악할 수 있습니다.
숙련된 다수의 전문가가 정확하고 다양한 유전체 분석 서비스를 제공해 드리고 있습니다.
Total RNA Sequencing
Random primer를 활용하여 RNA 샘플로부터 전사체의 발현정보를 확인할 수 있습니다. Coding/ non-coding RNA를 확인, Ribosomal RNA를 제거하여 다른 RNA(Pre-mRNA, mRNA, ncRNA, tRNA, miRNA, incRNA등)들에 대한 개선된 분석 결과를 얻으실 수 있습니다.
기본 분석으로 유전자 발현량(quant)과 추가 분석으로 DEG 분석을 지원해드립니다.
Service Info
| Library Kit | Illumina Library Standard Total RNA prep, Ligation with Ribo-Zero Plus |
|---|---|
| Sequencing platform | Novaseq 6000(PE 100bp) |
| Data output | 12G |
| Standard Analysis | Alighnment, Gene Expression |
| Turnaround time | 4 weeks (+DEG : 6 weeks) |
| Species | Human, Bacteria, Rat, Mouse |
Workflow
mRNA Sequencing
Polyadenylated(poly(A)) 혹은 coding region enrichment 방법을 활용하여 분석하는 실험으로, WTS 데이터를 활용하여 샘플 간의 유전자 발현 값의 차이(Expression Profiling)를 확인할 수 있습니다.
- Stranded 방식 : Poly(A) capture 방식을 사용하며, antisense transcription, enhances transcript annotation이 포함된 Data를 확인하실 수 있어 조금 더 넓은 범위의 gene expression을 확인하실 수 있습니다.
- Enrichment 방식 : Exome probe를 사용하여, NCBI/hg19 reference genome을 통해 98% 상당의 Refseq exome coverage로 Data 추출이 가능합니다. (*Human only)
기본 분석으로 유전자 발현량(quant)과 추가 분석으로 DEG 분석을 지원해드립니다.
Service Info
| Library Kit | Standard | Illumina Standard mRNA Prep, Ligation |
|---|---|---|
| Enrichment | Illumina RNA Prep with Enrichment, (L) Tag mentation | |
| Sequencing platform | NovaSeq 6000(PE 100bp) | |
| Data output | 6G | |
| Standard Analysis | Alignment, Gene Expression | |
| Turnaround time | 4 weeks (+DEG : 6 weeks) | |
| Species | Standard | Human, Bovine, Rat, Mouse |
| Enrichment | Human/ROVP | |
Workflow
